ក្រសួងប្រៃសណីយ៍និងទូរគមនាគមន៍មានអគ្គនាយកដ្ឋាន៣គឹ៖
ក. អគ្គនាយកដ្ឋានរដ្ឋបាល
- នាយកដ្ឋានរដ្ឋបាល
- នាយកដ្ឋាននិងបុគ្គលិកនិងបណ្តុះបណ្តាល
- នាយកដ្ឋានផែនការនិងហិរញ្ញវត្ថុ
ខ. អគ្គនាយកដ្ឋានប្រៃសណីយ៍និងទូរគមនាគមន៍
- នាយកដ្ឋានគោលនយោបាយទូរគមនាគមន៍
- នាយកដ្ឋានគោលនយោបាយប្រៃសណីយ៍
- នាយកដ្ឋានត្រួតពិនិត្យការគ្រប់គ្រងប្រៃសណីយ៍
- នាយកដ្ឋានសហប្រតិបត្តិការអន្តរជាតិ
- មជ្ឍមណ្ឌលគ្រប់គ្រងទិន្នន័យសេវាទូរគមនាគមន៍និងព៍ត៌មានវិទ្យា
គ. អគ្គនាយកដ្ឋានបច្ចេកវិទ្យាគមនាគមន៍និងព័ត៌មាន
- នាយកដ្ឋានរដ្ឋាភិបាលអេឡិចត្រូនិច
- នាយកដ្ឋានគោលនយោបាយបច្ចេកវិទ្យាគមនាគមន៍និងព័ត៌មាន
- នាយកដ្ឋានគ្រប់គ្រងហេដ្ឋារចនាសម្ព័ន្ធព័ត៌មានជាតិ និងគ្រប់គ្រងប្រព័ន្ធវីដេអូនៃសន្នីទរបស់រាជរដ្ឋាភិបាល
- នាយកដ្ឋានកម្មវិធីកុំព្យូទ័រនិងមាតិកាព័ត៌មាន
- នាយកដ្ឋានសន្តិសុខបច្ចេកវិទ្យាគមនាគមន៍និងព័ត៌មាន
- នាយកដ្ឋានឧស្សាហកម្មបច្ចេកវិទ្យាគមនាគមន៍និងព័ត៌មាន
- នាយកដ្ឋានបច្ចេកវិទ្យា គមនាគមន៍និងព័ត៌មានសម្រាប់ជនបទ ។